Наукові напрямки відділу:

• проведення теоретичних та прикладних досліджень у галузі моделювання складних процесів і систем за експериментальними даними в умовах невизначеності;
• розробка теорії та методів структурного аналізу і синтезу багатозв’язкових динамічних систем; 
• розробка відповідного математичного забезпечення та інформаційних технологій для інтерактивних програмних систем розв’язання прикладних задач; 
• координація досліджень з проблем моделювання в умовах невизначеності.